Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Muc2-201ENSMUST00000026590 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irf1P15314 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms