Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smim18J3QNP2 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms