Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Cldn34c3J3QJW5 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms