Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Gm20830J3KML6 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm20830J3KML6 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Gm20830J3KML6 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms