Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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