Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Zscan21-205ENSMUST00000110961 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm23266-201ENSMUST00000104444 134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Ms4a3-201ENSMUST00000112984 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm6285-201ENSMUST00000122012 498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 1700120E14Rik-201ENSMUST00000137034 732 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm12305-201ENSMUST00000151817 407 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm8964-201ENSMUST00000165944 805 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm6931-202ENSMUST00000183137 1009 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm42495-201ENSMUST00000200324 405 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 n-R5s33-201ENSMUST00000093713 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm9436-201ENSMUST00000120949 1855 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms