Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms