Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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