Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms