Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms