Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc97Q9DBT3 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc97Q9DBT3 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc97Q9DBT3 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc97Q9DBT3 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc97Q9DBT3 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc97Q9DBT3 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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