Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Zfp607a-201ENSMUST00000053722 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Hp1bp3-203ENSMUST00000105825 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm43012-201ENSMUST00000198569 937 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Slc2a9-205ENSMUST00000129099 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Mapk6-201ENSMUST00000049355 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bcl11bQ99PV8 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms