Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms