Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CipcQ8R0W1 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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