Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms