Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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