Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg9aQ68FE2 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms