Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Q3U6N9 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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