Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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