Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms