Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ttc39dQ0VF76 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms