Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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VdrP48281 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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