Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtpraP18052 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms