Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp35M0QWN7 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms