Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 673.7 ms