Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms