Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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