Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms