Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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