Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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