Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Prpf39Q8K2Z2 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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