Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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