Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms