Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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