Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FarsaQ8C0C7 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FarsaQ8C0C7 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms