Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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Zbtb40Q6PCS8 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Zbtb40Q6PCS8 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Zbtb40Q6PCS8 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Zbtb40Q6PCS8 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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Zbtb40Q6PCS8 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Zbtb40Q6PCS8 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Zbtb40Q6PCS8 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Zbtb40Q6PCS8 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Zbtb40Q6PCS8 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Zbtb40Q6PCS8 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Zbtb40Q6PCS8 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.4 ms