Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Sft2d1Q5SSN7 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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