Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp13Q5BKP2 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms