Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Gm28047Q3US59 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Gm28047Q3US59 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Gm28047Q3US59 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Gm28047Q3US59 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Gm28047Q3US59 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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