Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.2 ms