Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms