Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms