Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms