Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms