Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SbdsP70122 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms