Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms