Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
RxraP28700 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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