Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms