Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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BC067074F6RXI4 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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BC067074F6RXI4 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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BC067074F6RXI4 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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BC067074F6RXI4 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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BC067074F6RXI4 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BC067074F6RXI4 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms