Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Frmpd4A2AFR3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms